MS9540 имеет единственное отличие от модели MS9520 - режим CodeGate, обеспечивающий возможность сканирования необходимого штрих-кода при наличии в области сканирования нескольких штрих-кодов. Режим CodeGate автоматически отключается при размещении сканера на подставке. Настройки сканера позволяют, при необходимости, полностью отключить CodeGate и сканер будет работать как модель 9520.
Сканер оснащен запатентованной технологией автоматически включающей сканер при появлении в поле его зрения объекта сканирования.